Mucosectomia trata-se da retirada de lesões maiores do esôfago, estômago ou intestino.
O exame de Mucosectomia é realizado através de infusão de liquido embaixo da lesão, através de uma agulha específica. Com isso a lesão fica elevada diminuindo o risco de perfuração. A retirada é feita com a mesma alça utilizada para realização da polipectomia e o material é encaminhado para estudo anatomopatológico da mesma forma com que ocorre nas biópsias.